- 2021년 한국지능정보시스템학회 춘계학술대회 우수논문상, 전민진, 황지원, 김종우, "CNN 보조 손실을 이용한 차원 기반 감성 분석," 2021.6.11.
- 2019년 한국지능정보시스템학회 추계학술대회 최우수논문상, 이형일, 김종우, "사례기반추론과 텍스트마이닝 기법을 활용한 KTX 차량고장 지능형 조치지원시스템 연구," 2019. 10.26
- 2019년 한국지능정보시스템학회 추계학술대회 우수논문상, 김승수, 조미경, 김종우, "공공 데이터를 활용한 시스템 트레이딩 전략의 투자 성과 분석," 2019.10.26
- 2019년 한국지능정보시스템학회 춘계학술대회 우수논문상, 여운영, 이상원, 김현건, 김종우, "대화문에서의 다범주 감성 분석을 위한 Sequence-to-sequence 모델 활용 방안," 2019.6.1
- 2018년 세종도서 학술부문 선정(한국출판문화진흥원). 비즈니스 분석(김승민, 김인현, 김종우, 김진화, 김찬수, 박주석, 이재유, 이지선, 최광선), 한경사, 2018.12.20.
- 2018년 한국지능정보시스템학회 춘계학술대회 우수논문상, 김동성, 김기태, 여운영, 김종우, "딥러닝 기법을 활용한 한국어 문장에 대한 다범주 감성 분석 방안 연구", 2018.6.1
- 2015년 한국지능정보시스템학회 춘계공동학술대회 우수논문상, 정지선, 김동성, 김종우, "온라인 상의 뉴스 감성분석을 활용한 개별 주가 예측에 관한 연구", 2015.5.30
- 강의우수교수, 한양대학교, 2012.5.15
- 2010년도 대한민국학술원 기초학문육성 "우수학술도서" 선정. 경영을 위한 데이터마이닝 - 마케팅과 CRM 활용을 중심으로(김종우, 김선태 공역), 한경사.
- 강의우수교원, 한양대학교, 2008.5.15
- 2007년 한국데이터베이스학회 추계 학술대회 최우수 논문상, 허준, 김종우, "데이터 마이닝의 지도학습 기법인 불일치 패턴 모델의 특성 연구," 한국데이터베이스학회, 2007.11.23.
- 2004년 추계학술대회, 최우수 논문상, 조성경, 최상훈, 김종우, 장석권, "온라인 고객의 전환 행태 분석을 위한 확률 모형", 한국경영정보학회, 2004.11.12.
- 1999년 해외 Post-Doc 지원, 과제명: 가상상점에서 다수 지능형 에이전트를 활용한 개인화된 고객 웹 페이지 제공에 관한 연구, 한국과학재단, 1999.